مقعد به دلیل نقش مهمی که در اجابت مزاج و عمل دفع دارد از اعضای مهم بدن به شمار می رود
بسیاری از انسانها به دلیل خجالت و شرم از بیان مشکلات مقعدی خود و مراجعه به پزشک خودداری می کنند در صورتی که با به تاخیر انداختن درمان فقط روند درمان سخت تر خواهد شد و یا اینکه ممکن است برخی علائم نشان از سرطان مقعد باشد که در این صورت جان فرد در معرض خطر است
بیماری های مهم و شایع این ناحیه عبارتند از شقاق مقعد،بی اختیاری مدفوع،خارش مقعد، آبسه مقعد،هموروئید، کیست مویی،زگیل مقعد و ...
که به اختصار به برخی از این بیماری ها اشاره می شود :
هموروئید: وجود توده های سفت در داخل یا خارج مقعد که می تواند با درد و خونریزی همراه باشد
شقاق:یک پارگی و جراحت در انتهای دستگاه گوارش که با درد و خونریزی بعد از حرکت مدفوع از روده همراه است
زگیل مقعد: ناشی از ورود ویروسی به نام پاپیلوما یا اچ پی  وی است که در برخی مواقع به شکل زگیل بروز می کند که در بیشتر موارد مانند قارچ رشد میکنند
کیست مویی:کیست مویی یا سینوس پیلونیدال مربوط به ناحیه دنبالچه است که به جای این که موهای این ناحیه از ریشه به سمت پوست حرکت کند به سمت داخل و زیر پوست میرود و در این ناحیه ایجاد التهاب می کند
آبسه مقعدی: همان حفره عفونی و پرچرک نزدیک مقعد می باشد که معمولا با درد و تورم اطراف مقعد همراه است و تنها راه درمان آن تخلیه آبسه با ایجاد برش روی آبسه می باشد باید توجه داشت که عدم درمان به موقع باعث می شود که عفونت در بدن پخش میشود